Protein–RNA interactions for Protein: P49717

Mcm4, DNA replication licensing factor MCM4, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcm4P49717 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mcm4P49717 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mcm4P49717 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mcm4P49717 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mcm4P49717 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mcm4P49717 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mcm4P49717 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mcm4P49717 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mcm4P49717 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mcm4P49717 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mcm4P49717 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mcm4P49717 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mcm4P49717 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mcm4P49717 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mcm4P49717 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Mcm4P49717 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mcm4P49717 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mcm4P49717 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mcm4P49717 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mcm4P49717 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mcm4P49717 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mcm4P49717 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Mcm4P49717 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mcm4P49717 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mcm4P49717 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mcm4P49717 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mcm4P49717 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mcm4P49717 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Mcm4P49717 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Mcm4P49717 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mcm4P49717 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mcm4P49717 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mcm4P49717 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mcm4P49717 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mcm4P49717 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Mcm4P49717 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mcm4P49717 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mcm4P49717 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mcm4P49717 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Mcm4P49717 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mcm4P49717 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mcm4P49717 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mcm4P49717 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mcm4P49717 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mcm4P49717 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mcm4P49717 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mcm4P49717 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mcm4P49717 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mcm4P49717 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mcm4P49717 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mcm4P49717 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mcm4P49717 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mcm4P49717 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mcm4P49717 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Mcm4P49717 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mcm4P49717 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mcm4P49717 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mcm4P49717 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mcm4P49717 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mcm4P49717 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mcm4P49717 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mcm4P49717 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mcm4P49717 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mcm4P49717 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mcm4P49717 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mcm4P49717 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mcm4P49717 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mcm4P49717 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mcm4P49717 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mcm4P49717 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mcm4P49717 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mcm4P49717 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mcm4P49717 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mcm4P49717 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Mcm4P49717 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Mcm4P49717 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mcm4P49717 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mcm4P49717 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mcm4P49717 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mcm4P49717 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mcm4P49717 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mcm4P49717 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mcm4P49717 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mcm4P49717 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mcm4P49717 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mcm4P49717 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mcm4P49717 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mcm4P49717 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mcm4P49717 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mcm4P49717 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mcm4P49717 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mcm4P49717 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mcm4P49717 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mcm4P49717 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mcm4P49717 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mcm4P49717 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mcm4P49717 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mcm4P49717 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mcm4P49717 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mcm4P49717 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms