Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hcls1P49710 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Hcls1P49710 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hcls1P49710 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hcls1P49710 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hcls1P49710 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hcls1P49710 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hcls1P49710 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hcls1P49710 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hcls1P49710 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hcls1P49710 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hcls1P49710 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hcls1P49710 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hcls1P49710 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hcls1P49710 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hcls1P49710 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hcls1P49710 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hcls1P49710 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hcls1P49710 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hcls1P49710 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hcls1P49710 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hcls1P49710 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hcls1P49710 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hcls1P49710 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hcls1P49710 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hcls1P49710 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hcls1P49710 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hcls1P49710 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Hcls1P49710 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hcls1P49710 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hcls1P49710 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hcls1P49710 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hcls1P49710 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hcls1P49710 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hcls1P49710 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hcls1P49710 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hcls1P49710 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcls1P49710 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hcls1P49710 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hcls1P49710 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hcls1P49710 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hcls1P49710 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hcls1P49710 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hcls1P49710 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hcls1P49710 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hcls1P49710 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hcls1P49710 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hcls1P49710 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hcls1P49710 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hcls1P49710 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hcls1P49710 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hcls1P49710 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hcls1P49710 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hcls1P49710 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hcls1P49710 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.5 ms