Protein–RNA interactions for Protein: P49698

Hnf4a, Hepatocyte nuclear factor 4-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnf4aP49698 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hnf4aP49698 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hnf4aP49698 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hnf4aP49698 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hnf4aP49698 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hnf4aP49698 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hnf4aP49698 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hnf4aP49698 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hnf4aP49698 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hnf4aP49698 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hnf4aP49698 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hnf4aP49698 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hnf4aP49698 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hnf4aP49698 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hnf4aP49698 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hnf4aP49698 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hnf4aP49698 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hnf4aP49698 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hnf4aP49698 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hnf4aP49698 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hnf4aP49698 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hnf4aP49698 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hnf4aP49698 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hnf4aP49698 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hnf4aP49698 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hnf4aP49698 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hnf4aP49698 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hnf4aP49698 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hnf4aP49698 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hnf4aP49698 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hnf4aP49698 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hnf4aP49698 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hnf4aP49698 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hnf4aP49698 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hnf4aP49698 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hnf4aP49698 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hnf4aP49698 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hnf4aP49698 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hnf4aP49698 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hnf4aP49698 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hnf4aP49698 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hnf4aP49698 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hnf4aP49698 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hnf4aP49698 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hnf4aP49698 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hnf4aP49698 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hnf4aP49698 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hnf4aP49698 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hnf4aP49698 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hnf4aP49698 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hnf4aP49698 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hnf4aP49698 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hnf4aP49698 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hnf4aP49698 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hnf4aP49698 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hnf4aP49698 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hnf4aP49698 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hnf4aP49698 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hnf4aP49698 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hnf4aP49698 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hnf4aP49698 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hnf4aP49698 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hnf4aP49698 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hnf4aP49698 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hnf4aP49698 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hnf4aP49698 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hnf4aP49698 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hnf4aP49698 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hnf4aP49698 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hnf4aP49698 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hnf4aP49698 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hnf4aP49698 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hnf4aP49698 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hnf4aP49698 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hnf4aP49698 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hnf4aP49698 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hnf4aP49698 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hnf4aP49698 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hnf4aP49698 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hnf4aP49698 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hnf4aP49698 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hnf4aP49698 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hnf4aP49698 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hnf4aP49698 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hnf4aP49698 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hnf4aP49698 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hnf4aP49698 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hnf4aP49698 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hnf4aP49698 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hnf4aP49698 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hnf4aP49698 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hnf4aP49698 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hnf4aP49698 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hnf4aP49698 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hnf4aP49698 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hnf4aP49698 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hnf4aP49698 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hnf4aP49698 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hnf4aP49698 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hnf4aP49698 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.6 ms