Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTPAP49638 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTPAP49638 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTPAP49638 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTPAP49638 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTPAP49638 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTPAP49638 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTPAP49638 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTPAP49638 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTPAP49638 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTPAP49638 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTPAP49638 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTPAP49638 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTPAP49638 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTPAP49638 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTPAP49638 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTPAP49638 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTPAP49638 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTPAP49638 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTPAP49638 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TTPAP49638 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TTPAP49638 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TTPAP49638 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTPAP49638 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTPAP49638 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTPAP49638 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TTPAP49638 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTPAP49638 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTPAP49638 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTPAP49638 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TTPAP49638 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTPAP49638 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTPAP49638 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTPAP49638 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTPAP49638 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTPAP49638 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTPAP49638 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTPAP49638 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTPAP49638 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTPAP49638 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTPAP49638 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTPAP49638 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTPAP49638 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTPAP49638 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTPAP49638 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTPAP49638 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTPAP49638 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTPAP49638 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTPAP49638 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTPAP49638 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTPAP49638 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTPAP49638 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTPAP49638 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTPAP49638 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TTPAP49638 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TTPAP49638 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTPAP49638 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTPAP49638 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTPAP49638 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTPAP49638 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTPAP49638 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTPAP49638 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TTPAP49638 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTPAP49638 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTPAP49638 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTPAP49638 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTPAP49638 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTPAP49638 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTPAP49638 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTPAP49638 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTPAP49638 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTPAP49638 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TTPAP49638 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTPAP49638 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTPAP49638 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTPAP49638 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTPAP49638 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTPAP49638 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTPAP49638 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTPAP49638 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTPAP49638 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TTPAP49638 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTPAP49638 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTPAP49638 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTPAP49638 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTPAP49638 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TTPAP49638 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTPAP49638 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTPAP49638 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTPAP49638 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTPAP49638 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTPAP49638 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTPAP49638 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTPAP49638 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTPAP49638 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTPAP49638 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTPAP49638 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTPAP49638 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TTPAP49638 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
TTPAP49638 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
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