Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TNNI2P48788 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TNNI2P48788 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
TNNI2P48788 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNNI2P48788 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
TNNI2P48788 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNNI2P48788 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNNI2P48788 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TNNI2P48788 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TNNI2P48788 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNNI2P48788 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNNI2P48788 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TNNI2P48788 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TNNI2P48788 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TNNI2P48788 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TNNI2P48788 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TNNI2P48788 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TNNI2P48788 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TNNI2P48788 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TNNI2P48788 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TNNI2P48788 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNNI2P48788 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNNI2P48788 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNNI2P48788 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TNNI2P48788 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TNNI2P48788 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TNNI2P48788 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TNNI2P48788 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TNNI2P48788 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNNI2P48788 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNNI2P48788 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNNI2P48788 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNNI2P48788 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNNI2P48788 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TNNI2P48788 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TNNI2P48788 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TNNI2P48788 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TNNI2P48788 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
TNNI2P48788 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TNNI2P48788 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TNNI2P48788 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TNNI2P48788 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TNNI2P48788 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TNNI2P48788 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TNNI2P48788 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TNNI2P48788 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TNNI2P48788 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TNNI2P48788 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
TNNI2P48788 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TNNI2P48788 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TNNI2P48788 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TNNI2P48788 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TNNI2P48788 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TNNI2P48788 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TNNI2P48788 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TNNI2P48788 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TNNI2P48788 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TNNI2P48788 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TNNI2P48788 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TNNI2P48788 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TNNI2P48788 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TNNI2P48788 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TNNI2P48788 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TNNI2P48788 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TNNI2P48788 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TNNI2P48788 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TNNI2P48788 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TNNI2P48788 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TNNI2P48788 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TNNI2P48788 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TNNI2P48788 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TNNI2P48788 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
TNNI2P48788 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
TNNI2P48788 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TNNI2P48788 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms