Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GCLCP48506 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GCLCP48506 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GCLCP48506 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GCLCP48506 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GCLCP48506 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GCLCP48506 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GCLCP48506 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GCLCP48506 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GCLCP48506 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GCLCP48506 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GCLCP48506 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GCLCP48506 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GCLCP48506 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GCLCP48506 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GCLCP48506 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GCLCP48506 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GCLCP48506 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GCLCP48506 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GCLCP48506 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GCLCP48506 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GCLCP48506 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GCLCP48506 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GCLCP48506 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GCLCP48506 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GCLCP48506 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GCLCP48506 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
GCLCP48506 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GCLCP48506 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GCLCP48506 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GCLCP48506 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GCLCP48506 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GCLCP48506 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GCLCP48506 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GCLCP48506 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GCLCP48506 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
GCLCP48506 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GCLCP48506 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GCLCP48506 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GCLCP48506 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GCLCP48506 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GCLCP48506 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GCLCP48506 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GCLCP48506 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GCLCP48506 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GCLCP48506 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GCLCP48506 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GCLCP48506 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GCLCP48506 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GCLCP48506 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GCLCP48506 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GCLCP48506 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GCLCP48506 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GCLCP48506 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GCLCP48506 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GCLCP48506 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GCLCP48506 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GCLCP48506 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GCLCP48506 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GCLCP48506 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GCLCP48506 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GCLCP48506 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GCLCP48506 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GCLCP48506 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GCLCP48506 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GCLCP48506 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GCLCP48506 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GCLCP48506 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GCLCP48506 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GCLCP48506 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GCLCP48506 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GCLCP48506 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GCLCP48506 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GCLCP48506 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GCLCP48506 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GCLCP48506 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GCLCP48506 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GCLCP48506 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GCLCP48506 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GCLCP48506 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GCLCP48506 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GCLCP48506 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GCLCP48506 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GCLCP48506 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GCLCP48506 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
GCLCP48506 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GCLCP48506 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GCLCP48506 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
GCLCP48506 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GCLCP48506 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GCLCP48506 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GCLCP48506 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GCLCP48506 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GCLCP48506 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GCLCP48506 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
GCLCP48506 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GCLCP48506 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GCLCP48506 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GCLCP48506 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
GCLCP48506 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms