Protein–RNA interactions for Protein: P48052

CPA2, Carboxypeptidase A2, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA2P48052 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CPA2P48052 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CPA2P48052 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPA2P48052 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPA2P48052 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPA2P48052 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA2P48052 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPA2P48052 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA2P48052 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CPA2P48052 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA2P48052 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPA2P48052 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA2P48052 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA2P48052 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA2P48052 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA2P48052 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA2P48052 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPA2P48052 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CPA2P48052 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA2P48052 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA2P48052 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA2P48052 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPA2P48052 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA2P48052 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA2P48052 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA2P48052 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPA2P48052 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPA2P48052 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CPA2P48052 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA2P48052 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA2P48052 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CPA2P48052 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA2P48052 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPA2P48052 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA2P48052 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA2P48052 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPA2P48052 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPA2P48052 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPA2P48052 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPA2P48052 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPA2P48052 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA2P48052 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA2P48052 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPA2P48052 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA2P48052 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA2P48052 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPA2P48052 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA2P48052 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA2P48052 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPA2P48052 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA2P48052 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA2P48052 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA2P48052 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA2P48052 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPA2P48052 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CPA2P48052 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CPA2P48052 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA2P48052 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA2P48052 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA2P48052 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA2P48052 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPA2P48052 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPA2P48052 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA2P48052 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPA2P48052 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA2P48052 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPA2P48052 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPA2P48052 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPA2P48052 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPA2P48052 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA2P48052 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA2P48052 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA2P48052 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPA2P48052 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CPA2P48052 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA2P48052 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPA2P48052 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA2P48052 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA2P48052 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA2P48052 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA2P48052 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA2P48052 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPA2P48052 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA2P48052 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA2P48052 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA2P48052 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPA2P48052 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPA2P48052 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPA2P48052 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA2P48052 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA2P48052 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA2P48052 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA2P48052 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA2P48052 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA2P48052 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA2P48052 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA2P48052 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA2P48052 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA2P48052 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA2P48052 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms