Protein–RNA interactions for Protein: P48029

SLC6A8, Sodium- and chloride-dependent creatine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A8P48029 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A8P48029 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC6A8P48029 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A8P48029 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A8P48029 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A8P48029 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A8P48029 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A8P48029 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A8P48029 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A8P48029 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A8P48029 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A8P48029 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A8P48029 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A8P48029 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A8P48029 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A8P48029 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A8P48029 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A8P48029 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A8P48029 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A8P48029 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A8P48029 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC6A8P48029 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC6A8P48029 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC6A8P48029 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms