Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pax7P47239 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pax7P47239 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pax7P47239 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pax7P47239 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pax7P47239 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pax7P47239 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pax7P47239 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pax7P47239 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pax7P47239 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pax7P47239 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pax7P47239 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pax7P47239 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pax7P47239 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pax7P47239 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pax7P47239 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pax7P47239 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pax7P47239 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pax7P47239 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pax7P47239 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pax7P47239 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pax7P47239 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pax7P47239 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pax7P47239 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pax7P47239 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pax7P47239 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pax7P47239 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pax7P47239 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pax7P47239 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pax7P47239 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pax7P47239 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pax7P47239 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pax7P47239 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pax7P47239 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pax7P47239 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pax7P47239 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pax7P47239 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pax7P47239 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pax7P47239 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pax7P47239 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pax7P47239 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pax7P47239 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pax7P47239 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pax7P47239 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pax7P47239 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pax7P47239 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pax7P47239 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pax7P47239 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pax7P47239 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pax7P47239 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pax7P47239 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pax7P47239 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pax7P47239 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pax7P47239 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pax7P47239 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pax7P47239 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pax7P47239 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pax7P47239 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pax7P47239 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pax7P47239 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pax7P47239 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pax7P47239 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pax7P47239 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pax7P47239 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pax7P47239 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pax7P47239 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pax7P47239 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pax7P47239 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pax7P47239 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pax7P47239 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pax7P47239 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pax7P47239 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pax7P47239 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pax7P47239 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pax7P47239 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pax7P47239 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pax7P47239 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pax7P47239 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pax7P47239 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pax7P47239 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pax7P47239 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pax7P47239 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pax7P47239 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pax7P47239 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pax7P47239 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pax7P47239 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pax7P47239 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pax7P47239 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pax7P47239 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pax7P47239 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pax7P47239 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pax7P47239 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pax7P47239 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pax7P47239 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pax7P47239 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pax7P47239 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pax7P47239 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pax7P47239 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pax7P47239 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pax7P47239 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms