Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
IQGAP1P46940 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
IQGAP1P46940 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
IQGAP1P46940 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
IQGAP1P46940 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
IQGAP1P46940 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
IQGAP1P46940 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
IQGAP1P46940 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
IQGAP1P46940 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
IQGAP1P46940 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
IQGAP1P46940 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
IQGAP1P46940 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
IQGAP1P46940 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
IQGAP1P46940 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
IQGAP1P46940 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
IQGAP1P46940 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
IQGAP1P46940 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
IQGAP1P46940 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
IQGAP1P46940 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
IQGAP1P46940 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
IQGAP1P46940 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
IQGAP1P46940 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
IQGAP1P46940 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
IQGAP1P46940 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
IQGAP1P46940 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
IQGAP1P46940 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
IQGAP1P46940 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
IQGAP1P46940 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
IQGAP1P46940 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
IQGAP1P46940 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
IQGAP1P46940 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
IQGAP1P46940 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
IQGAP1P46940 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
IQGAP1P46940 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.47■■■■□ 3.75
IQGAP1P46940 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
IQGAP1P46940 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
IQGAP1P46940 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
IQGAP1P46940 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
IQGAP1P46940 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
IQGAP1P46940 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
IQGAP1P46940 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
IQGAP1P46940 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
IQGAP1P46940 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
IQGAP1P46940 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
IQGAP1P46940 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
IQGAP1P46940 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
IQGAP1P46940 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
IQGAP1P46940 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
IQGAP1P46940 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
IQGAP1P46940 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
IQGAP1P46940 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
IQGAP1P46940 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
IQGAP1P46940 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
IQGAP1P46940 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
IQGAP1P46940 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.73
IQGAP1P46940 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
IQGAP1P46940 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
IQGAP1P46940 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
IQGAP1P46940 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
IQGAP1P46940 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
IQGAP1P46940 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
IQGAP1P46940 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
IQGAP1P46940 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
IQGAP1P46940 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
IQGAP1P46940 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
IQGAP1P46940 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
IQGAP1P46940 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
IQGAP1P46940 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
IQGAP1P46940 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
IQGAP1P46940 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
IQGAP1P46940 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
IQGAP1P46940 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
IQGAP1P46940 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
IQGAP1P46940 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
IQGAP1P46940 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
IQGAP1P46940 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
IQGAP1P46940 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
IQGAP1P46940 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.71
IQGAP1P46940 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
IQGAP1P46940 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
IQGAP1P46940 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
IQGAP1P46940 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
IQGAP1P46940 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
IQGAP1P46940 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
IQGAP1P46940 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
IQGAP1P46940 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
IQGAP1P46940 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
IQGAP1P46940 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
IQGAP1P46940 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
IQGAP1P46940 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
IQGAP1P46940 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
IQGAP1P46940 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
IQGAP1P46940 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
IQGAP1P46940 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
IQGAP1P46940 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
IQGAP1P46940 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
IQGAP1P46940 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
IQGAP1P46940 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
IQGAP1P46940 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
IQGAP1P46940 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms