Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPL21P46778 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPL21P46778 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPL21P46778 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPL21P46778 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPL21P46778 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RPL21P46778 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPL21P46778 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPL21P46778 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPL21P46778 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPL21P46778 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPL21P46778 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPL21P46778 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RPL21P46778 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPL21P46778 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RPL21P46778 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RPL21P46778 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPL21P46778 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPL21P46778 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPL21P46778 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPL21P46778 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPL21P46778 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPL21P46778 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPL21P46778 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPL21P46778 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPL21P46778 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPL21P46778 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPL21P46778 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPL21P46778 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPL21P46778 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPL21P46778 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPL21P46778 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RPL21P46778 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPL21P46778 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPL21P46778 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPL21P46778 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RPL21P46778 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPL21P46778 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPL21P46778 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPL21P46778 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RPL21P46778 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RPL21P46778 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RPL21P46778 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPL21P46778 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPL21P46778 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPL21P46778 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPL21P46778 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPL21P46778 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPL21P46778 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPL21P46778 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPL21P46778 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPL21P46778 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPL21P46778 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RPL21P46778 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL21P46778 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL21P46778 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPL21P46778 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL21P46778 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL21P46778 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL21P46778 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL21P46778 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPL21P46778 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL21P46778 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL21P46778 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL21P46778 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL21P46778 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL21P46778 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPL21P46778 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPL21P46778 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPL21P46778 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPL21P46778 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPL21P46778 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL21P46778 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL21P46778 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL21P46778 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPL21P46778 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL21P46778 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL21P46778 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL21P46778 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL21P46778 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL21P46778 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPL21P46778 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPL21P46778 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPL21P46778 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPL21P46778 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPL21P46778 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPL21P46778 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPL21P46778 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPL21P46778 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPL21P46778 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPL21P46778 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPL21P46778 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPL21P46778 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPL21P46778 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPL21P46778 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPL21P46778 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPL21P46778 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPL21P46778 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPL21P46778 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPL21P46778 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms