Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zic1P46684 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zic1P46684 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zic1P46684 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zic1P46684 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zic1P46684 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zic1P46684 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zic1P46684 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zic1P46684 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zic1P46684 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zic1P46684 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Zic1P46684 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zic1P46684 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zic1P46684 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zic1P46684 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zic1P46684 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zic1P46684 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zic1P46684 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zic1P46684 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zic1P46684 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zic1P46684 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zic1P46684 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zic1P46684 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Zic1P46684 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zic1P46684 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Zic1P46684 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zic1P46684 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zic1P46684 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zic1P46684 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zic1P46684 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zic1P46684 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zic1P46684 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zic1P46684 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zic1P46684 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zic1P46684 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zic1P46684 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zic1P46684 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zic1P46684 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zic1P46684 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zic1P46684 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zic1P46684 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zic1P46684 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zic1P46684 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zic1P46684 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zic1P46684 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zic1P46684 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zic1P46684 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zic1P46684 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zic1P46684 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zic1P46684 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zic1P46684 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zic1P46684 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zic1P46684 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zic1P46684 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zic1P46684 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zic1P46684 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zic1P46684 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zic1P46684 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zic1P46684 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zic1P46684 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zic1P46684 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zic1P46684 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Zic1P46684 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zic1P46684 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zic1P46684 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zic1P46684 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zic1P46684 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zic1P46684 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zic1P46684 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zic1P46684 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zic1P46684 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zic1P46684 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zic1P46684 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zic1P46684 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zic1P46684 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zic1P46684 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zic1P46684 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zic1P46684 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zic1P46684 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zic1P46684 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zic1P46684 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zic1P46684 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zic1P46684 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zic1P46684 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zic1P46684 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Zic1P46684 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Zic1P46684 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zic1P46684 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zic1P46684 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zic1P46684 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zic1P46684 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zic1P46684 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zic1P46684 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zic1P46684 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zic1P46684 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zic1P46684 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zic1P46684 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zic1P46684 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zic1P46684 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zic1P46684 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms