Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RECQLP46063 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RECQLP46063 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RECQLP46063 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RECQLP46063 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RECQLP46063 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RECQLP46063 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RECQLP46063 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RECQLP46063 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RECQLP46063 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RECQLP46063 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RECQLP46063 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RECQLP46063 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RECQLP46063 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RECQLP46063 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RECQLP46063 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RECQLP46063 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RECQLP46063 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RECQLP46063 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RECQLP46063 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RECQLP46063 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RECQLP46063 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RECQLP46063 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RECQLP46063 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RECQLP46063 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RECQLP46063 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RECQLP46063 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RECQLP46063 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RECQLP46063 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RECQLP46063 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RECQLP46063 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RECQLP46063 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RECQLP46063 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RECQLP46063 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RECQLP46063 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RECQLP46063 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RECQLP46063 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RECQLP46063 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RECQLP46063 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RECQLP46063 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RECQLP46063 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RECQLP46063 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RECQLP46063 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RECQLP46063 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RECQLP46063 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RECQLP46063 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RECQLP46063 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RECQLP46063 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RECQLP46063 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RECQLP46063 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RECQLP46063 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RECQLP46063 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RECQLP46063 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RECQLP46063 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RECQLP46063 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RECQLP46063 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RECQLP46063 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RECQLP46063 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RECQLP46063 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RECQLP46063 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RECQLP46063 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RECQLP46063 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RECQLP46063 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RECQLP46063 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RECQLP46063 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RECQLP46063 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RECQLP46063 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RECQLP46063 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RECQLP46063 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RECQLP46063 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RECQLP46063 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RECQLP46063 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RECQLP46063 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RECQLP46063 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RECQLP46063 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RECQLP46063 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RECQLP46063 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RECQLP46063 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RECQLP46063 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RECQLP46063 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RECQLP46063 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RECQLP46063 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RECQLP46063 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RECQLP46063 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RECQLP46063 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RECQLP46063 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RECQLP46063 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RECQLP46063 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RECQLP46063 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RECQLP46063 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RECQLP46063 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RECQLP46063 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RECQLP46063 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RECQLP46063 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RECQLP46063 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RECQLP46063 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RECQLP46063 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RECQLP46063 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RECQLP46063 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RECQLP46063 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms