Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCG1P45844 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCG1P45844 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCG1P45844 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCG1P45844 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCG1P45844 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCG1P45844 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCG1P45844 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCG1P45844 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCG1P45844 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCG1P45844 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCG1P45844 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCG1P45844 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCG1P45844 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCG1P45844 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCG1P45844 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCG1P45844 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCG1P45844 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCG1P45844 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCG1P45844 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCG1P45844 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCG1P45844 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCG1P45844 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCG1P45844 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCG1P45844 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCG1P45844 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCG1P45844 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCG1P45844 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCG1P45844 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCG1P45844 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCG1P45844 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCG1P45844 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCG1P45844 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCG1P45844 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCG1P45844 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ABCG1P45844 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCG1P45844 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ABCG1P45844 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCG1P45844 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ABCG1P45844 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCG1P45844 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCG1P45844 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCG1P45844 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCG1P45844 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ABCG1P45844 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCG1P45844 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ABCG1P45844 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCG1P45844 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ABCG1P45844 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ABCG1P45844 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCG1P45844 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ABCG1P45844 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ABCG1P45844 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCG1P45844 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCG1P45844 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCG1P45844 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCG1P45844 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCG1P45844 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCG1P45844 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCG1P45844 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCG1P45844 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCG1P45844 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCG1P45844 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCG1P45844 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCG1P45844 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCG1P45844 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCG1P45844 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ABCG1P45844 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCG1P45844 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCG1P45844 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCG1P45844 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCG1P45844 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCG1P45844 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCG1P45844 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCG1P45844 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCG1P45844 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCG1P45844 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCG1P45844 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCG1P45844 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCG1P45844 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCG1P45844 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCG1P45844 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCG1P45844 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCG1P45844 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCG1P45844 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCG1P45844 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCG1P45844 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCG1P45844 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ABCG1P45844 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCG1P45844 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCG1P45844 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCG1P45844 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCG1P45844 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCG1P45844 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCG1P45844 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCG1P45844 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCG1P45844 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCG1P45844 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCG1P45844 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCG1P45844 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms