Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MAGEA4P43358 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MAGEA4P43358 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAGEA4P43358 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAGEA4P43358 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAGEA4P43358 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MAGEA4P43358 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MAGEA4P43358 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAGEA4P43358 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAGEA4P43358 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAGEA4P43358 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MAGEA4P43358 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAGEA4P43358 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAGEA4P43358 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MAGEA4P43358 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAGEA4P43358 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAGEA4P43358 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAGEA4P43358 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAGEA4P43358 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MAGEA4P43358 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAGEA4P43358 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MAGEA4P43358 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAGEA4P43358 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MAGEA4P43358 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MAGEA4P43358 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAGEA4P43358 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAGEA4P43358 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MAGEA4P43358 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MAGEA4P43358 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAGEA4P43358 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAGEA4P43358 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAGEA4P43358 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAGEA4P43358 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAGEA4P43358 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAGEA4P43358 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAGEA4P43358 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAGEA4P43358 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MAGEA4P43358 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAGEA4P43358 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAGEA4P43358 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAGEA4P43358 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAGEA4P43358 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAGEA4P43358 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAGEA4P43358 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MAGEA4P43358 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MAGEA4P43358 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MAGEA4P43358 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MAGEA4P43358 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MAGEA4P43358 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MAGEA4P43358 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MAGEA4P43358 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAGEA4P43358 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAGEA4P43358 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAGEA4P43358 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAGEA4P43358 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAGEA4P43358 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAGEA4P43358 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAGEA4P43358 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAGEA4P43358 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAGEA4P43358 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAGEA4P43358 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAGEA4P43358 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAGEA4P43358 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAGEA4P43358 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MAGEA4P43358 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MAGEA4P43358 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MAGEA4P43358 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MAGEA4P43358 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MAGEA4P43358 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MAGEA4P43358 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MAGEA4P43358 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MAGEA4P43358 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MAGEA4P43358 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MAGEA4P43358 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MAGEA4P43358 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MAGEA4P43358 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MAGEA4P43358 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MAGEA4P43358 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MAGEA4P43358 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms