Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GDF5P43026 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDF5P43026 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GDF5P43026 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GDF5P43026 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDF5P43026 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDF5P43026 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GDF5P43026 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDF5P43026 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDF5P43026 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GDF5P43026 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF5P43026 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF5P43026 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDF5P43026 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GDF5P43026 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF5P43026 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF5P43026 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDF5P43026 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDF5P43026 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDF5P43026 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF5P43026 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF5P43026 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF5P43026 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF5P43026 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF5P43026 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDF5P43026 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF5P43026 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GDF5P43026 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF5P43026 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF5P43026 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF5P43026 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF5P43026 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF5P43026 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF5P43026 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF5P43026 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF5P43026 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF5P43026 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF5P43026 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF5P43026 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF5P43026 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF5P43026 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF5P43026 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF5P43026 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF5P43026 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF5P43026 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF5P43026 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF5P43026 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF5P43026 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF5P43026 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF5P43026 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF5P43026 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF5P43026 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF5P43026 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF5P43026 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF5P43026 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF5P43026 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF5P43026 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF5P43026 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF5P43026 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF5P43026 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF5P43026 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF5P43026 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF5P43026 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF5P43026 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF5P43026 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF5P43026 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF5P43026 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF5P43026 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GDF5P43026 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GDF5P43026 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF5P43026 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF5P43026 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF5P43026 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF5P43026 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF5P43026 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF5P43026 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF5P43026 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF5P43026 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF5P43026 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF5P43026 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF5P43026 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF5P43026 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF5P43026 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF5P43026 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF5P43026 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF5P43026 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF5P43026 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF5P43026 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF5P43026 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF5P43026 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF5P43026 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF5P43026 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF5P43026 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF5P43026 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF5P43026 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF5P43026 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF5P43026 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF5P43026 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF5P43026 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF5P43026 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms