Protein–RNA interactions for Protein: P41217

CD200, OX-2 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD200P41217 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD200P41217 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD200P41217 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD200P41217 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD200P41217 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD200P41217 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD200P41217 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD200P41217 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD200P41217 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CD200P41217 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD200P41217 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD200P41217 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD200P41217 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD200P41217 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD200P41217 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD200P41217 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD200P41217 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD200P41217 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD200P41217 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD200P41217 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD200P41217 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD200P41217 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD200P41217 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD200P41217 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD200P41217 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CD200P41217 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD200P41217 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD200P41217 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD200P41217 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD200P41217 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD200P41217 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD200P41217 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD200P41217 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD200P41217 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD200P41217 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD200P41217 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD200P41217 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD200P41217 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD200P41217 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD200P41217 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD200P41217 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD200P41217 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD200P41217 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD200P41217 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD200P41217 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD200P41217 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD200P41217 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD200P41217 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CD200P41217 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD200P41217 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD200P41217 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD200P41217 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD200P41217 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD200P41217 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD200P41217 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD200P41217 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD200P41217 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CD200P41217 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD200P41217 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD200P41217 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD200P41217 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD200P41217 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD200P41217 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD200P41217 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD200P41217 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD200P41217 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD200P41217 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD200P41217 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD200P41217 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CD200P41217 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD200P41217 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD200P41217 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD200P41217 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD200P41217 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD200P41217 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD200P41217 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD200P41217 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD200P41217 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD200P41217 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD200P41217 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD200P41217 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD200P41217 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD200P41217 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD200P41217 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD200P41217 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD200P41217 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD200P41217 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD200P41217 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD200P41217 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD200P41217 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD200P41217 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD200P41217 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD200P41217 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD200P41217 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD200P41217 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD200P41217 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD200P41217 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD200P41217 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD200P41217 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD200P41217 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms