Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PEX19P40855 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX19P40855 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX19P40855 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX19P40855 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX19P40855 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX19P40855 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX19P40855 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PEX19P40855 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX19P40855 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX19P40855 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX19P40855 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX19P40855 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX19P40855 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PEX19P40855 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX19P40855 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PEX19P40855 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX19P40855 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PEX19P40855 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX19P40855 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX19P40855 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX19P40855 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX19P40855 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX19P40855 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX19P40855 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PEX19P40855 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX19P40855 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PEX19P40855 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PEX19P40855 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX19P40855 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX19P40855 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PEX19P40855 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEX19P40855 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PEX19P40855 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEX19P40855 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PEX19P40855 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PEX19P40855 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PEX19P40855 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PEX19P40855 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PEX19P40855 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX19P40855 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX19P40855 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX19P40855 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PEX19P40855 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PEX19P40855 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PEX19P40855 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX19P40855 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX19P40855 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX19P40855 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX19P40855 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PEX19P40855 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX19P40855 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PEX19P40855 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX19P40855 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX19P40855 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PEX19P40855 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX19P40855 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PEX19P40855 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX19P40855 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX19P40855 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX19P40855 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX19P40855 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX19P40855 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PEX19P40855 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX19P40855 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX19P40855 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PEX19P40855 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX19P40855 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX19P40855 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX19P40855 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX19P40855 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PEX19P40855 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PEX19P40855 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PEX19P40855 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PEX19P40855 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PEX19P40855 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX19P40855 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX19P40855 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX19P40855 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX19P40855 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PEX19P40855 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX19P40855 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PEX19P40855 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX19P40855 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX19P40855 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX19P40855 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PEX19P40855 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX19P40855 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX19P40855 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PEX19P40855 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX19P40855 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX19P40855 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX19P40855 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PEX19P40855 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PEX19P40855 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PEX19P40855 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX19P40855 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX19P40855 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PEX19P40855 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PEX19P40855 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.3 ms