Protein–RNA interactions for Protein: P40123

CAP2, Adenylyl cyclase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP2P40123 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CAP2P40123 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CAP2P40123 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CAP2P40123 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CAP2P40123 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CAP2P40123 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CAP2P40123 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CAP2P40123 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CAP2P40123 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CAP2P40123 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CAP2P40123 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CAP2P40123 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CAP2P40123 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CAP2P40123 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CAP2P40123 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CAP2P40123 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CAP2P40123 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CAP2P40123 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CAP2P40123 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CAP2P40123 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CAP2P40123 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CAP2P40123 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
CAP2P40123 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CAP2P40123 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CAP2P40123 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CAP2P40123 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CAP2P40123 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CAP2P40123 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CAP2P40123 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CAP2P40123 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CAP2P40123 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CAP2P40123 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CAP2P40123 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CAP2P40123 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CAP2P40123 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CAP2P40123 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CAP2P40123 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CAP2P40123 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CAP2P40123 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CAP2P40123 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CAP2P40123 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CAP2P40123 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CAP2P40123 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CAP2P40123 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CAP2P40123 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CAP2P40123 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CAP2P40123 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CAP2P40123 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CAP2P40123 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CAP2P40123 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CAP2P40123 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CAP2P40123 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CAP2P40123 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CAP2P40123 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CAP2P40123 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CAP2P40123 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CAP2P40123 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CAP2P40123 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CAP2P40123 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CAP2P40123 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CAP2P40123 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CAP2P40123 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CAP2P40123 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CAP2P40123 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CAP2P40123 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CAP2P40123 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CAP2P40123 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CAP2P40123 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAP2P40123 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAP2P40123 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAP2P40123 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAP2P40123 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CAP2P40123 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CAP2P40123 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CAP2P40123 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CAP2P40123 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CAP2P40123 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CAP2P40123 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
CAP2P40123 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CAP2P40123 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CAP2P40123 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CAP2P40123 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CAP2P40123 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CAP2P40123 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CAP2P40123 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CAP2P40123 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CAP2P40123 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CAP2P40123 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CAP2P40123 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CAP2P40123 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CAP2P40123 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CAP2P40123 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CAP2P40123 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CAP2P40123 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CAP2P40123 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CAP2P40123 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CAP2P40123 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CAP2P40123 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CAP2P40123 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CAP2P40123 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms