Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grik2P39087 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grik2P39087 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grik2P39087 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grik2P39087 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grik2P39087 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grik2P39087 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grik2P39087 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grik2P39087 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grik2P39087 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grik2P39087 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik2P39087 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik2P39087 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik2P39087 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik2P39087 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grik2P39087 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik2P39087 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik2P39087 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik2P39087 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grik2P39087 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grik2P39087 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grik2P39087 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grik2P39087 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Grik2P39087 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grik2P39087 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik2P39087 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik2P39087 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik2P39087 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik2P39087 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik2P39087 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik2P39087 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik2P39087 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grik2P39087 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grik2P39087 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grik2P39087 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grik2P39087 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grik2P39087 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grik2P39087 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grik2P39087 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik2P39087 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik2P39087 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik2P39087 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik2P39087 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grik2P39087 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grik2P39087 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grik2P39087 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grik2P39087 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grik2P39087 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grik2P39087 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grik2P39087 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grik2P39087 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grik2P39087 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grik2P39087 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grik2P39087 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grik2P39087 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grik2P39087 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik2P39087 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik2P39087 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik2P39087 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik2P39087 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grik2P39087 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grik2P39087 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grik2P39087 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grik2P39087 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grik2P39087 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grik2P39087 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Grik2P39087 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Grik2P39087 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grik2P39087 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grik2P39087 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grik2P39087 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grik2P39087 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grik2P39087 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grik2P39087 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grik2P39087 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grik2P39087 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik2P39087 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik2P39087 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grik2P39087 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grik2P39087 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms