Protein–RNA interactions for Protein: P39059

COL15A1, Collagen alpha-1(XV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL15A1P39059 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
COL15A1P39059 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
COL15A1P39059 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
COL15A1P39059 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
COL15A1P39059 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
COL15A1P39059 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
COL15A1P39059 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
COL15A1P39059 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
COL15A1P39059 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
COL15A1P39059 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
COL15A1P39059 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
COL15A1P39059 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
COL15A1P39059 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
COL15A1P39059 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
COL15A1P39059 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
COL15A1P39059 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
COL15A1P39059 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
COL15A1P39059 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
COL15A1P39059 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
COL15A1P39059 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
COL15A1P39059 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
COL15A1P39059 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
COL15A1P39059 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
COL15A1P39059 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
COL15A1P39059 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
COL15A1P39059 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.82■■■■□ 3
COL15A1P39059 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.82■■■■□ 3
COL15A1P39059 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.82■■■■□ 3
COL15A1P39059 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.82■■■■□ 3
COL15A1P39059 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.82■■■■□ 3
COL15A1P39059 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.82■■■■□ 3
COL15A1P39059 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.82■■■■□ 3
COL15A1P39059 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.82■■■■□ 3
COL15A1P39059 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.82■■■■□ 3
COL15A1P39059 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
COL15A1P39059 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.8■■■■□ 3
COL15A1P39059 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
COL15A1P39059 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
COL15A1P39059 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
COL15A1P39059 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
COL15A1P39059 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
COL15A1P39059 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
COL15A1P39059 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
COL15A1P39059 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
COL15A1P39059 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
COL15A1P39059 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
COL15A1P39059 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
COL15A1P39059 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
COL15A1P39059 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
COL15A1P39059 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
COL15A1P39059 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
COL15A1P39059 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
COL15A1P39059 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
COL15A1P39059 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
COL15A1P39059 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
COL15A1P39059 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
COL15A1P39059 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
COL15A1P39059 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
COL15A1P39059 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
COL15A1P39059 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
COL15A1P39059 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
COL15A1P39059 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
COL15A1P39059 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
COL15A1P39059 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
COL15A1P39059 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
COL15A1P39059 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
COL15A1P39059 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
COL15A1P39059 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
COL15A1P39059 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
COL15A1P39059 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
COL15A1P39059 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
COL15A1P39059 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
COL15A1P39059 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
COL15A1P39059 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
COL15A1P39059 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
COL15A1P39059 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
COL15A1P39059 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
COL15A1P39059 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
COL15A1P39059 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
COL15A1P39059 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
COL15A1P39059 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
COL15A1P39059 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
COL15A1P39059 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
COL15A1P39059 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
COL15A1P39059 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
COL15A1P39059 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
COL15A1P39059 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
COL15A1P39059 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL15A1P39059 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
COL15A1P39059 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
COL15A1P39059 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
COL15A1P39059 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
COL15A1P39059 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
COL15A1P39059 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
COL15A1P39059 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
COL15A1P39059 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
COL15A1P39059 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
COL15A1P39059 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
COL15A1P39059 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
COL15A1P39059 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms