Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPARGP37231 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPARGP37231 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPARGP37231 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PPARGP37231 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPARGP37231 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPARGP37231 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPARGP37231 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPARGP37231 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPARGP37231 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPARGP37231 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPARGP37231 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPARGP37231 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPARGP37231 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PPARGP37231 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPARGP37231 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPARGP37231 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPARGP37231 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPARGP37231 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPARGP37231 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPARGP37231 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPARGP37231 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPARGP37231 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPARGP37231 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PPARGP37231 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPARGP37231 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPARGP37231 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPARGP37231 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPARGP37231 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPARGP37231 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPARGP37231 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPARGP37231 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPARGP37231 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPARGP37231 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPARGP37231 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPARGP37231 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPARGP37231 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PPARGP37231 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPARGP37231 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPARGP37231 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPARGP37231 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPARGP37231 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPARGP37231 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPARGP37231 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPARGP37231 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPARGP37231 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PPARGP37231 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPARGP37231 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPARGP37231 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPARGP37231 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPARGP37231 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPARGP37231 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPARGP37231 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPARGP37231 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPARGP37231 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPARGP37231 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPARGP37231 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPARGP37231 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPARGP37231 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPARGP37231 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPARGP37231 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPARGP37231 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PPARGP37231 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPARGP37231 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPARGP37231 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPARGP37231 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPARGP37231 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PPARGP37231 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPARGP37231 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPARGP37231 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPARGP37231 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPARGP37231 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPARGP37231 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPARGP37231 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPARGP37231 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPARGP37231 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPARGP37231 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPARGP37231 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPARGP37231 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPARGP37231 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPARGP37231 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPARGP37231 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPARGP37231 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPARGP37231 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPARGP37231 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPARGP37231 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPARGP37231 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPARGP37231 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPARGP37231 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPARGP37231 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPARGP37231 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPARGP37231 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPARGP37231 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPARGP37231 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPARGP37231 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPARGP37231 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPARGP37231 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPARGP37231 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPARGP37231 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPARGP37231 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms