Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62P37198 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62P37198 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62P37198 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP62P37198 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP62P37198 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP62P37198 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP62P37198 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP62P37198 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP62P37198 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP62P37198 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP62P37198 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP62P37198 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP62P37198 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP62P37198 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP62P37198 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP62P37198 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP62P37198 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP62P37198 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUP62P37198 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP62P37198 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP62P37198 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP62P37198 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP62P37198 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP62P37198 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUP62P37198 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP62P37198 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP62P37198 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP62P37198 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP62P37198 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP62P37198 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP62P37198 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP62P37198 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP62P37198 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP62P37198 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP62P37198 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP62P37198 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP62P37198 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP62P37198 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP62P37198 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP62P37198 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP62P37198 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP62P37198 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP62P37198 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP62P37198 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP62P37198 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP62P37198 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP62P37198 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP62P37198 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP62P37198 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP62P37198 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP62P37198 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP62P37198 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP62P37198 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP62P37198 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP62P37198 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP62P37198 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP62P37198 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP62P37198 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP62P37198 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP62P37198 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP62P37198 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP62P37198 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP62P37198 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP62P37198 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP62P37198 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP62P37198 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP62P37198 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP62P37198 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP62P37198 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP62P37198 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP62P37198 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP62P37198 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP62P37198 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP62P37198 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP62P37198 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP62P37198 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP62P37198 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP62P37198 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP62P37198 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP62P37198 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP62P37198 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP62P37198 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP62P37198 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP62P37198 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP62P37198 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP62P37198 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP62P37198 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP62P37198 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP62P37198 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP62P37198 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP62P37198 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP62P37198 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP62P37198 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP62P37198 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP62P37198 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP62P37198 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP62P37198 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP62P37198 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP62P37198 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms