Protein–RNA interactions for Protein: P35951

Ldlr, Low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdlrP35951 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LdlrP35951 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LdlrP35951 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LdlrP35951 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LdlrP35951 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LdlrP35951 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LdlrP35951 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LdlrP35951 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LdlrP35951 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LdlrP35951 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LdlrP35951 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LdlrP35951 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LdlrP35951 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LdlrP35951 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LdlrP35951 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LdlrP35951 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LdlrP35951 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LdlrP35951 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LdlrP35951 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LdlrP35951 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LdlrP35951 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LdlrP35951 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LdlrP35951 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LdlrP35951 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LdlrP35951 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LdlrP35951 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LdlrP35951 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LdlrP35951 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LdlrP35951 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LdlrP35951 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LdlrP35951 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LdlrP35951 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LdlrP35951 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LdlrP35951 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LdlrP35951 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LdlrP35951 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LdlrP35951 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LdlrP35951 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LdlrP35951 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LdlrP35951 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LdlrP35951 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LdlrP35951 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LdlrP35951 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LdlrP35951 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LdlrP35951 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LdlrP35951 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LdlrP35951 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LdlrP35951 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LdlrP35951 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LdlrP35951 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LdlrP35951 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LdlrP35951 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LdlrP35951 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LdlrP35951 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LdlrP35951 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LdlrP35951 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LdlrP35951 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LdlrP35951 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LdlrP35951 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LdlrP35951 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LdlrP35951 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LdlrP35951 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LdlrP35951 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
LdlrP35951 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LdlrP35951 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LdlrP35951 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LdlrP35951 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LdlrP35951 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LdlrP35951 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LdlrP35951 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LdlrP35951 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LdlrP35951 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LdlrP35951 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LdlrP35951 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LdlrP35951 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LdlrP35951 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LdlrP35951 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LdlrP35951 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LdlrP35951 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LdlrP35951 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.7 ms