Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptpn1P35821 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpn1P35821 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpn1P35821 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpn1P35821 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpn1P35821 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptpn1P35821 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptpn1P35821 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptpn1P35821 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptpn1P35821 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ptpn1P35821 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptpn1P35821 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptpn1P35821 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptpn1P35821 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptpn1P35821 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpn1P35821 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn1P35821 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn1P35821 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpn1P35821 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpn1P35821 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpn1P35821 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpn1P35821 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpn1P35821 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpn1P35821 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptpn1P35821 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptpn1P35821 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptpn1P35821 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ptpn1P35821 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpn1P35821 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpn1P35821 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpn1P35821 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ptpn1P35821 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpn1P35821 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpn1P35821 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptpn1P35821 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptpn1P35821 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptpn1P35821 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptpn1P35821 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ptpn1P35821 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn1P35821 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptpn1P35821 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptpn1P35821 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptpn1P35821 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptpn1P35821 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptpn1P35821 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ptpn1P35821 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptpn1P35821 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptpn1P35821 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpn1P35821 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpn1P35821 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptpn1P35821 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptpn1P35821 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpn1P35821 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ptpn1P35821 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ptpn1P35821 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ptpn1P35821 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ptpn1P35821 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn1P35821 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpn1P35821 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpn1P35821 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpn1P35821 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpn1P35821 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptpn1P35821 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpn1P35821 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpn1P35821 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpn1P35821 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpn1P35821 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpn1P35821 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpn1P35821 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpn1P35821 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpn1P35821 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpn1P35821 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpn1P35821 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpn1P35821 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpn1P35821 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpn1P35821 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpn1P35821 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptpn1P35821 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptpn1P35821 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptpn1P35821 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms