Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHKAP35790 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHKAP35790 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHKAP35790 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHKAP35790 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHKAP35790 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHKAP35790 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHKAP35790 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHKAP35790 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHKAP35790 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHKAP35790 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHKAP35790 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHKAP35790 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHKAP35790 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHKAP35790 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHKAP35790 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHKAP35790 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHKAP35790 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHKAP35790 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHKAP35790 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHKAP35790 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHKAP35790 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHKAP35790 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHKAP35790 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHKAP35790 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHKAP35790 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHKAP35790 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHKAP35790 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHKAP35790 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHKAP35790 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHKAP35790 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHKAP35790 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHKAP35790 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHKAP35790 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHKAP35790 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHKAP35790 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHKAP35790 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHKAP35790 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
CHKAP35790 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CHKAP35790 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHKAP35790 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHKAP35790 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHKAP35790 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHKAP35790 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHKAP35790 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHKAP35790 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHKAP35790 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHKAP35790 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHKAP35790 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHKAP35790 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHKAP35790 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHKAP35790 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHKAP35790 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHKAP35790 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHKAP35790 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHKAP35790 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CHKAP35790 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHKAP35790 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHKAP35790 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHKAP35790 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CHKAP35790 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHKAP35790 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHKAP35790 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHKAP35790 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHKAP35790 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHKAP35790 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHKAP35790 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHKAP35790 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHKAP35790 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHKAP35790 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHKAP35790 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHKAP35790 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHKAP35790 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHKAP35790 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHKAP35790 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHKAP35790 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHKAP35790 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHKAP35790 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHKAP35790 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHKAP35790 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHKAP35790 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHKAP35790 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHKAP35790 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHKAP35790 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHKAP35790 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHKAP35790 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHKAP35790 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CHKAP35790 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHKAP35790 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHKAP35790 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHKAP35790 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHKAP35790 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHKAP35790 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHKAP35790 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHKAP35790 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHKAP35790 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CHKAP35790 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHKAP35790 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHKAP35790 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHKAP35790 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms