Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYLC1P35663 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYLC1P35663 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYLC1P35663 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYLC1P35663 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYLC1P35663 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYLC1P35663 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYLC1P35663 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYLC1P35663 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYLC1P35663 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYLC1P35663 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYLC1P35663 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CYLC1P35663 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYLC1P35663 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYLC1P35663 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYLC1P35663 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYLC1P35663 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYLC1P35663 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYLC1P35663 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYLC1P35663 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYLC1P35663 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYLC1P35663 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYLC1P35663 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYLC1P35663 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYLC1P35663 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CYLC1P35663 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYLC1P35663 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYLC1P35663 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CYLC1P35663 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYLC1P35663 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYLC1P35663 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYLC1P35663 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYLC1P35663 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYLC1P35663 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYLC1P35663 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYLC1P35663 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CYLC1P35663 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYLC1P35663 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYLC1P35663 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYLC1P35663 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYLC1P35663 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYLC1P35663 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYLC1P35663 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYLC1P35663 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYLC1P35663 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYLC1P35663 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYLC1P35663 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CYLC1P35663 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYLC1P35663 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYLC1P35663 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYLC1P35663 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYLC1P35663 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYLC1P35663 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYLC1P35663 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYLC1P35663 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYLC1P35663 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYLC1P35663 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYLC1P35663 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYLC1P35663 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYLC1P35663 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYLC1P35663 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYLC1P35663 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYLC1P35663 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYLC1P35663 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYLC1P35663 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYLC1P35663 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CYLC1P35663 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYLC1P35663 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYLC1P35663 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYLC1P35663 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYLC1P35663 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYLC1P35663 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYLC1P35663 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYLC1P35663 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYLC1P35663 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYLC1P35663 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYLC1P35663 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYLC1P35663 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYLC1P35663 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYLC1P35663 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYLC1P35663 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYLC1P35663 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYLC1P35663 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYLC1P35663 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYLC1P35663 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYLC1P35663 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CYLC1P35663 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYLC1P35663 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYLC1P35663 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYLC1P35663 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYLC1P35663 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYLC1P35663 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYLC1P35663 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYLC1P35663 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CYLC1P35663 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CYLC1P35663 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYLC1P35663 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYLC1P35663 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYLC1P35663 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYLC1P35663 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms