Protein–RNA interactions for Protein: P35441

Thbs1, Thrombospondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1P35441 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thbs1P35441 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Thbs1P35441 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thbs1P35441 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thbs1P35441 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thbs1P35441 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thbs1P35441 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Thbs1P35441 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Thbs1P35441 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Thbs1P35441 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thbs1P35441 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Thbs1P35441 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thbs1P35441 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thbs1P35441 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thbs1P35441 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thbs1P35441 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thbs1P35441 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thbs1P35441 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thbs1P35441 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thbs1P35441 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thbs1P35441 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thbs1P35441 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Thbs1P35441 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Thbs1P35441 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Thbs1P35441 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Thbs1P35441 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Thbs1P35441 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thbs1P35441 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thbs1P35441 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thbs1P35441 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Thbs1P35441 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thbs1P35441 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thbs1P35441 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thbs1P35441 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thbs1P35441 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thbs1P35441 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thbs1P35441 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Thbs1P35441 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thbs1P35441 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thbs1P35441 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thbs1P35441 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thbs1P35441 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Thbs1P35441 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thbs1P35441 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Thbs1P35441 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thbs1P35441 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thbs1P35441 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thbs1P35441 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thbs1P35441 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thbs1P35441 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thbs1P35441 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thbs1P35441 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Thbs1P35441 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Thbs1P35441 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thbs1P35441 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thbs1P35441 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thbs1P35441 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thbs1P35441 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thbs1P35441 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thbs1P35441 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thbs1P35441 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Thbs1P35441 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thbs1P35441 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Thbs1P35441 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Thbs1P35441 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Thbs1P35441 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Thbs1P35441 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Thbs1P35441 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Thbs1P35441 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Thbs1P35441 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Thbs1P35441 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thbs1P35441 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thbs1P35441 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thbs1P35441 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thbs1P35441 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thbs1P35441 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Thbs1P35441 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thbs1P35441 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Thbs1P35441 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thbs1P35441 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Thbs1P35441 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thbs1P35441 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thbs1P35441 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Thbs1P35441 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Thbs1P35441 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thbs1P35441 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thbs1P35441 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thbs1P35441 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thbs1P35441 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Thbs1P35441 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thbs1P35441 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thbs1P35441 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thbs1P35441 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thbs1P35441 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thbs1P35441 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thbs1P35441 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thbs1P35441 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thbs1P35441 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thbs1P35441 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thbs1P35441 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms