Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab21P35282 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab21P35282 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab21P35282 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab21P35282 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab21P35282 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab21P35282 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab21P35282 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab21P35282 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab21P35282 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rab21P35282 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab21P35282 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab21P35282 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab21P35282 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab21P35282 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab21P35282 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab21P35282 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab21P35282 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab21P35282 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab21P35282 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab21P35282 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab21P35282 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab21P35282 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab21P35282 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab21P35282 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab21P35282 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rab21P35282 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab21P35282 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab21P35282 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab21P35282 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab21P35282 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab21P35282 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab21P35282 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab21P35282 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab21P35282 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab21P35282 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab21P35282 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab21P35282 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab21P35282 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab21P35282 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab21P35282 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab21P35282 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab21P35282 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab21P35282 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab21P35282 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab21P35282 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab21P35282 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab21P35282 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab21P35282 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab21P35282 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab21P35282 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab21P35282 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab21P35282 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab21P35282 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab21P35282 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rab21P35282 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab21P35282 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab21P35282 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab21P35282 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab21P35282 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab21P35282 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab21P35282 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab21P35282 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab21P35282 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab21P35282 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab21P35282 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab21P35282 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab21P35282 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab21P35282 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab21P35282 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab21P35282 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab21P35282 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab21P35282 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab21P35282 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab21P35282 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab21P35282 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab21P35282 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab21P35282 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab21P35282 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab21P35282 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab21P35282 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab21P35282 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab21P35282 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab21P35282 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab21P35282 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab21P35282 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab21P35282 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab21P35282 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab21P35282 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab21P35282 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab21P35282 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab21P35282 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab21P35282 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab21P35282 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab21P35282 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab21P35282 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab21P35282 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab21P35282 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab21P35282 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab21P35282 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.9 ms