Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RPA3P35244 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPA3P35244 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPA3P35244 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RPA3P35244 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPA3P35244 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPA3P35244 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPA3P35244 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPA3P35244 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPA3P35244 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPA3P35244 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPA3P35244 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPA3P35244 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPA3P35244 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPA3P35244 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPA3P35244 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RPA3P35244 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPA3P35244 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPA3P35244 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPA3P35244 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPA3P35244 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPA3P35244 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RPA3P35244 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPA3P35244 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPA3P35244 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPA3P35244 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPA3P35244 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPA3P35244 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPA3P35244 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPA3P35244 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPA3P35244 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPA3P35244 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPA3P35244 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPA3P35244 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPA3P35244 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPA3P35244 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RPA3P35244 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPA3P35244 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPA3P35244 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RPA3P35244 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPA3P35244 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPA3P35244 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPA3P35244 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPA3P35244 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPA3P35244 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPA3P35244 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPA3P35244 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPA3P35244 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPA3P35244 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RPA3P35244 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPA3P35244 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPA3P35244 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPA3P35244 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPA3P35244 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPA3P35244 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPA3P35244 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPA3P35244 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPA3P35244 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPA3P35244 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPA3P35244 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPA3P35244 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPA3P35244 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPA3P35244 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPA3P35244 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPA3P35244 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPA3P35244 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPA3P35244 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPA3P35244 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPA3P35244 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RPA3P35244 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPA3P35244 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPA3P35244 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPA3P35244 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPA3P35244 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPA3P35244 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPA3P35244 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPA3P35244 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPA3P35244 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RPA3P35244 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPA3P35244 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPA3P35244 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPA3P35244 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPA3P35244 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RPA3P35244 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPA3P35244 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPA3P35244 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPA3P35244 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPA3P35244 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPA3P35244 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPA3P35244 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPA3P35244 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPA3P35244 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPA3P35244 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPA3P35244 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPA3P35244 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPA3P35244 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPA3P35244 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPA3P35244 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPA3P35244 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RPA3P35244 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms