Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stfa3P35173 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stfa3P35173 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stfa3P35173 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stfa3P35173 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stfa3P35173 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stfa3P35173 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stfa3P35173 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stfa3P35173 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stfa3P35173 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stfa3P35173 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Stfa3P35173 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stfa3P35173 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stfa3P35173 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stfa3P35173 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stfa3P35173 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stfa3P35173 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stfa3P35173 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stfa3P35173 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stfa3P35173 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Stfa3P35173 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stfa3P35173 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stfa3P35173 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stfa3P35173 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stfa3P35173 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stfa3P35173 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stfa3P35173 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stfa3P35173 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Stfa3P35173 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stfa3P35173 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stfa3P35173 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stfa3P35173 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stfa3P35173 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stfa3P35173 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stfa3P35173 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Stfa3P35173 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Stfa3P35173 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stfa3P35173 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Stfa3P35173 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stfa3P35173 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stfa3P35173 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stfa3P35173 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stfa3P35173 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stfa3P35173 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stfa3P35173 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stfa3P35173 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stfa3P35173 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stfa3P35173 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stfa3P35173 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stfa3P35173 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stfa3P35173 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stfa3P35173 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Stfa3P35173 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stfa3P35173 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Stfa3P35173 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stfa3P35173 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stfa3P35173 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stfa3P35173 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stfa3P35173 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stfa3P35173 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stfa3P35173 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stfa3P35173 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stfa3P35173 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stfa3P35173 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stfa3P35173 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stfa3P35173 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stfa3P35173 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stfa3P35173 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stfa3P35173 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stfa3P35173 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stfa3P35173 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stfa3P35173 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stfa3P35173 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stfa3P35173 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stfa3P35173 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stfa3P35173 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Stfa3P35173 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stfa3P35173 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stfa3P35173 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stfa3P35173 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stfa3P35173 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stfa3P35173 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stfa3P35173 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stfa3P35173 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stfa3P35173 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms