Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPC1P35052 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC1P35052 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC1P35052 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC1P35052 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPC1P35052 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC1P35052 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC1P35052 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPC1P35052 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC1P35052 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC1P35052 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPC1P35052 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC1P35052 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC1P35052 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC1P35052 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPC1P35052 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC1P35052 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC1P35052 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC1P35052 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPC1P35052 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPC1P35052 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC1P35052 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC1P35052 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPC1P35052 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC1P35052 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GPC1P35052 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC1P35052 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC1P35052 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC1P35052 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GPC1P35052 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC1P35052 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC1P35052 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC1P35052 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GPC1P35052 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC1P35052 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC1P35052 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC1P35052 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GPC1P35052 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC1P35052 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC1P35052 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC1P35052 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC1P35052 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC1P35052 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC1P35052 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPC1P35052 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC1P35052 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPC1P35052 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPC1P35052 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPC1P35052 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPC1P35052 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPC1P35052 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC1P35052 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPC1P35052 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC1P35052 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC1P35052 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC1P35052 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPC1P35052 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC1P35052 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC1P35052 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC1P35052 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC1P35052 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC1P35052 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC1P35052 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPC1P35052 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC1P35052 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC1P35052 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GPC1P35052 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC1P35052 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPC1P35052 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC1P35052 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC1P35052 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC1P35052 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC1P35052 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC1P35052 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC1P35052 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPC1P35052 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC1P35052 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPC1P35052 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPC1P35052 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPC1P35052 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC1P35052 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC1P35052 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC1P35052 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GPC1P35052 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC1P35052 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC1P35052 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC1P35052 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC1P35052 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC1P35052 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC1P35052 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC1P35052 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC1P35052 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC1P35052 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC1P35052 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC1P35052 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC1P35052 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC1P35052 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC1P35052 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC1P35052 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC1P35052 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms