Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCD1P33897 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCD1P33897 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCD1P33897 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCD1P33897 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCD1P33897 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCD1P33897 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCD1P33897 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCD1P33897 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCD1P33897 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCD1P33897 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCD1P33897 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCD1P33897 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCD1P33897 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCD1P33897 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCD1P33897 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCD1P33897 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCD1P33897 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCD1P33897 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCD1P33897 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCD1P33897 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCD1P33897 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCD1P33897 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCD1P33897 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCD1P33897 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCD1P33897 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCD1P33897 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCD1P33897 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCD1P33897 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCD1P33897 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCD1P33897 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCD1P33897 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCD1P33897 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCD1P33897 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCD1P33897 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCD1P33897 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCD1P33897 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCD1P33897 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCD1P33897 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCD1P33897 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ABCD1P33897 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCD1P33897 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCD1P33897 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCD1P33897 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ABCD1P33897 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCD1P33897 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ABCD1P33897 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCD1P33897 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ABCD1P33897 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCD1P33897 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCD1P33897 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ABCD1P33897 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ABCD1P33897 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCD1P33897 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCD1P33897 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ABCD1P33897 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCD1P33897 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCD1P33897 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCD1P33897 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ABCD1P33897 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ABCD1P33897 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCD1P33897 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ABCD1P33897 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCD1P33897 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ABCD1P33897 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCD1P33897 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCD1P33897 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCD1P33897 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ABCD1P33897 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCD1P33897 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ABCD1P33897 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ABCD1P33897 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCD1P33897 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCD1P33897 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCD1P33897 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ABCD1P33897 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCD1P33897 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ABCD1P33897 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCD1P33897 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ABCD1P33897 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCD1P33897 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ABCD1P33897 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCD1P33897 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCD1P33897 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ABCD1P33897 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCD1P33897 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCD1P33897 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCD1P33897 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCD1P33897 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCD1P33897 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ABCD1P33897 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCD1P33897 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCD1P33897 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms