Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GBP2P32456 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GBP2P32456 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GBP2P32456 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GBP2P32456 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GBP2P32456 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GBP2P32456 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GBP2P32456 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GBP2P32456 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GBP2P32456 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GBP2P32456 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP2P32456 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP2P32456 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GBP2P32456 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GBP2P32456 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GBP2P32456 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GBP2P32456 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GBP2P32456 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GBP2P32456 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GBP2P32456 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GBP2P32456 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GBP2P32456 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GBP2P32456 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GBP2P32456 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GBP2P32456 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GBP2P32456 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GBP2P32456 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GBP2P32456 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GBP2P32456 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GBP2P32456 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GBP2P32456 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GBP2P32456 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GBP2P32456 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GBP2P32456 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GBP2P32456 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GBP2P32456 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GBP2P32456 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GBP2P32456 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GBP2P32456 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
GBP2P32456 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GBP2P32456 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GBP2P32456 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GBP2P32456 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GBP2P32456 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GBP2P32456 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GBP2P32456 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GBP2P32456 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GBP2P32456 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GBP2P32456 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GBP2P32456 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GBP2P32456 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GBP2P32456 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GBP2P32456 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GBP2P32456 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GBP2P32456 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GBP2P32456 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GBP2P32456 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GBP2P32456 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP2P32456 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP2P32456 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP2P32456 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP2P32456 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP2P32456 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GBP2P32456 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GBP2P32456 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GBP2P32456 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GBP2P32456 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GBP2P32456 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GBP2P32456 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GBP2P32456 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GBP2P32456 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GBP2P32456 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GBP2P32456 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GBP2P32456 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBP2P32456 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBP2P32456 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBP2P32456 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GBP2P32456 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GBP2P32456 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GBP2P32456 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GBP2P32456 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP2P32456 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP2P32456 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GBP2P32456 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP2P32456 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GBP2P32456 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GBP2P32456 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP2P32456 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP2P32456 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP2P32456 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GBP2P32456 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GBP2P32456 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GBP2P32456 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GBP2P32456 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GBP2P32456 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GBP2P32456 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GBP2P32456 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GBP2P32456 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GBP2P32456 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GBP2P32456 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms