Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRS3P32247 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRS3P32247 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRS3P32247 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRS3P32247 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRS3P32247 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRS3P32247 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRS3P32247 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRS3P32247 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRS3P32247 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRS3P32247 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRS3P32247 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRS3P32247 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRS3P32247 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRS3P32247 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRS3P32247 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRS3P32247 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRS3P32247 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRS3P32247 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRS3P32247 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRS3P32247 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRS3P32247 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRS3P32247 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRS3P32247 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BRS3P32247 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRS3P32247 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRS3P32247 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRS3P32247 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRS3P32247 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRS3P32247 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRS3P32247 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRS3P32247 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRS3P32247 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRS3P32247 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRS3P32247 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRS3P32247 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRS3P32247 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRS3P32247 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRS3P32247 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRS3P32247 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRS3P32247 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRS3P32247 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRS3P32247 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRS3P32247 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRS3P32247 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRS3P32247 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRS3P32247 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRS3P32247 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRS3P32247 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRS3P32247 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRS3P32247 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRS3P32247 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRS3P32247 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRS3P32247 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRS3P32247 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRS3P32247 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRS3P32247 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRS3P32247 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BRS3P32247 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRS3P32247 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRS3P32247 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BRS3P32247 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRS3P32247 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRS3P32247 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRS3P32247 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRS3P32247 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BRS3P32247 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRS3P32247 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRS3P32247 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRS3P32247 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRS3P32247 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRS3P32247 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRS3P32247 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRS3P32247 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRS3P32247 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BRS3P32247 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRS3P32247 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRS3P32247 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRS3P32247 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRS3P32247 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRS3P32247 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRS3P32247 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRS3P32247 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRS3P32247 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRS3P32247 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRS3P32247 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRS3P32247 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRS3P32247 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRS3P32247 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRS3P32247 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRS3P32247 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRS3P32247 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BRS3P32247 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRS3P32247 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRS3P32247 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRS3P32247 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRS3P32247 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRS3P32247 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRS3P32247 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BRS3P32247 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms