Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASQ1P31415 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASQ1P31415 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASQ1P31415 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASQ1P31415 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASQ1P31415 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASQ1P31415 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASQ1P31415 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASQ1P31415 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASQ1P31415 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CASQ1P31415 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASQ1P31415 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASQ1P31415 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASQ1P31415 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASQ1P31415 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASQ1P31415 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASQ1P31415 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASQ1P31415 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASQ1P31415 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASQ1P31415 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASQ1P31415 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASQ1P31415 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASQ1P31415 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASQ1P31415 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASQ1P31415 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASQ1P31415 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASQ1P31415 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASQ1P31415 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASQ1P31415 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASQ1P31415 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASQ1P31415 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASQ1P31415 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASQ1P31415 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASQ1P31415 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASQ1P31415 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CASQ1P31415 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASQ1P31415 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASQ1P31415 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASQ1P31415 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASQ1P31415 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASQ1P31415 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASQ1P31415 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASQ1P31415 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASQ1P31415 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASQ1P31415 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASQ1P31415 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASQ1P31415 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASQ1P31415 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASQ1P31415 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASQ1P31415 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASQ1P31415 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASQ1P31415 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASQ1P31415 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASQ1P31415 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASQ1P31415 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASQ1P31415 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASQ1P31415 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASQ1P31415 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASQ1P31415 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASQ1P31415 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASQ1P31415 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASQ1P31415 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASQ1P31415 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASQ1P31415 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASQ1P31415 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASQ1P31415 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASQ1P31415 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASQ1P31415 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASQ1P31415 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CASQ1P31415 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CASQ1P31415 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASQ1P31415 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASQ1P31415 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CASQ1P31415 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CASQ1P31415 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CASQ1P31415 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASQ1P31415 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CASQ1P31415 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASQ1P31415 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASQ1P31415 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASQ1P31415 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASQ1P31415 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASQ1P31415 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASQ1P31415 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASQ1P31415 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASQ1P31415 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASQ1P31415 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASQ1P31415 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASQ1P31415 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASQ1P31415 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CASQ1P31415 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASQ1P31415 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASQ1P31415 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASQ1P31415 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASQ1P31415 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CASQ1P31415 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASQ1P31415 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASQ1P31415 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CASQ1P31415 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CASQ1P31415 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms