Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDC27P30260 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDC27P30260 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDC27P30260 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDC27P30260 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDC27P30260 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDC27P30260 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDC27P30260 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CDC27P30260 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDC27P30260 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDC27P30260 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDC27P30260 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDC27P30260 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CDC27P30260 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CDC27P30260 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDC27P30260 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDC27P30260 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDC27P30260 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDC27P30260 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
CDC27P30260 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CDC27P30260 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDC27P30260 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CDC27P30260 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CDC27P30260 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CDC27P30260 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CDC27P30260 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDC27P30260 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CDC27P30260 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CDC27P30260 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDC27P30260 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CDC27P30260 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CDC27P30260 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDC27P30260 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDC27P30260 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDC27P30260 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDC27P30260 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CDC27P30260 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDC27P30260 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CDC27P30260 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CDC27P30260 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDC27P30260 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDC27P30260 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDC27P30260 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDC27P30260 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CDC27P30260 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDC27P30260 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDC27P30260 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDC27P30260 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDC27P30260 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDC27P30260 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CDC27P30260 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDC27P30260 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CDC27P30260 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDC27P30260 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDC27P30260 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDC27P30260 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CDC27P30260 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDC27P30260 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CDC27P30260 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDC27P30260 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDC27P30260 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDC27P30260 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDC27P30260 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDC27P30260 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDC27P30260 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDC27P30260 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CDC27P30260 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CDC27P30260 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDC27P30260 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CDC27P30260 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDC27P30260 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDC27P30260 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDC27P30260 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDC27P30260 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDC27P30260 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CDC27P30260 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CDC27P30260 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CDC27P30260 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDC27P30260 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDC27P30260 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDC27P30260 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDC27P30260 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDC27P30260 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDC27P30260 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CDC27P30260 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CDC27P30260 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CDC27P30260 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CDC27P30260 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CDC27P30260 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CDC27P30260 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDC27P30260 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDC27P30260 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CDC27P30260 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDC27P30260 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CDC27P30260 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDC27P30260 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CDC27P30260 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CDC27P30260 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDC27P30260 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CDC27P30260 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms