Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALDH4A1P30038 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALDH4A1P30038 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALDH4A1P30038 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALDH4A1P30038 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALDH4A1P30038 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALDH4A1P30038 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALDH4A1P30038 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALDH4A1P30038 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALDH4A1P30038 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALDH4A1P30038 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALDH4A1P30038 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALDH4A1P30038 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALDH4A1P30038 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALDH4A1P30038 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALDH4A1P30038 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALDH4A1P30038 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALDH4A1P30038 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALDH4A1P30038 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ALDH4A1P30038 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALDH4A1P30038 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALDH4A1P30038 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ALDH4A1P30038 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ALDH4A1P30038 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALDH4A1P30038 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALDH4A1P30038 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ALDH4A1P30038 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALDH4A1P30038 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALDH4A1P30038 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH4A1P30038 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH4A1P30038 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH4A1P30038 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH4A1P30038 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALDH4A1P30038 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALDH4A1P30038 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALDH4A1P30038 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALDH4A1P30038 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALDH4A1P30038 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALDH4A1P30038 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALDH4A1P30038 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALDH4A1P30038 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALDH4A1P30038 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALDH4A1P30038 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ALDH4A1P30038 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALDH4A1P30038 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALDH4A1P30038 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALDH4A1P30038 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ALDH4A1P30038 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ALDH4A1P30038 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ALDH4A1P30038 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALDH4A1P30038 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALDH4A1P30038 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALDH4A1P30038 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALDH4A1P30038 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALDH4A1P30038 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALDH4A1P30038 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALDH4A1P30038 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ALDH4A1P30038 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ALDH4A1P30038 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ALDH4A1P30038 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALDH4A1P30038 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALDH4A1P30038 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALDH4A1P30038 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALDH4A1P30038 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALDH4A1P30038 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH4A1P30038 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH4A1P30038 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH4A1P30038 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH4A1P30038 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH4A1P30038 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALDH4A1P30038 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALDH4A1P30038 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALDH4A1P30038 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALDH4A1P30038 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALDH4A1P30038 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALDH4A1P30038 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALDH4A1P30038 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALDH4A1P30038 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms