Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VtnP29788 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VtnP29788 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VtnP29788 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VtnP29788 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VtnP29788 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VtnP29788 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VtnP29788 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VtnP29788 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VtnP29788 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VtnP29788 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VtnP29788 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VtnP29788 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VtnP29788 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VtnP29788 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VtnP29788 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VtnP29788 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VtnP29788 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VtnP29788 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VtnP29788 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VtnP29788 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VtnP29788 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VtnP29788 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VtnP29788 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VtnP29788 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VtnP29788 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VtnP29788 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VtnP29788 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VtnP29788 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VtnP29788 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VtnP29788 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VtnP29788 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VtnP29788 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VtnP29788 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VtnP29788 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VtnP29788 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VtnP29788 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VtnP29788 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VtnP29788 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VtnP29788 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VtnP29788 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VtnP29788 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VtnP29788 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VtnP29788 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VtnP29788 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VtnP29788 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VtnP29788 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VtnP29788 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VtnP29788 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VtnP29788 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VtnP29788 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
VtnP29788 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VtnP29788 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VtnP29788 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VtnP29788 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VtnP29788 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VtnP29788 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VtnP29788 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VtnP29788 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VtnP29788 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VtnP29788 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VtnP29788 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VtnP29788 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VtnP29788 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VtnP29788 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VtnP29788 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VtnP29788 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VtnP29788 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VtnP29788 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VtnP29788 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VtnP29788 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VtnP29788 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VtnP29788 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VtnP29788 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VtnP29788 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VtnP29788 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VtnP29788 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VtnP29788 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VtnP29788 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VtnP29788 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VtnP29788 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VtnP29788 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VtnP29788 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VtnP29788 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VtnP29788 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VtnP29788 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VtnP29788 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VtnP29788 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VtnP29788 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VtnP29788 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VtnP29788 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VtnP29788 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VtnP29788 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VtnP29788 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VtnP29788 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VtnP29788 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VtnP29788 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VtnP29788 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VtnP29788 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VtnP29788 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.8 ms