Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBMS1P29558 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBMS1P29558 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBMS1P29558 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RBMS1P29558 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBMS1P29558 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBMS1P29558 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBMS1P29558 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBMS1P29558 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RBMS1P29558 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBMS1P29558 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBMS1P29558 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBMS1P29558 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBMS1P29558 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBMS1P29558 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBMS1P29558 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBMS1P29558 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBMS1P29558 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBMS1P29558 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBMS1P29558 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBMS1P29558 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBMS1P29558 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBMS1P29558 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBMS1P29558 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBMS1P29558 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBMS1P29558 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBMS1P29558 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBMS1P29558 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBMS1P29558 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBMS1P29558 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBMS1P29558 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RBMS1P29558 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBMS1P29558 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBMS1P29558 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBMS1P29558 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RBMS1P29558 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBMS1P29558 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RBMS1P29558 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBMS1P29558 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBMS1P29558 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBMS1P29558 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBMS1P29558 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBMS1P29558 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBMS1P29558 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBMS1P29558 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBMS1P29558 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RBMS1P29558 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBMS1P29558 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBMS1P29558 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBMS1P29558 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBMS1P29558 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RBMS1P29558 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBMS1P29558 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RBMS1P29558 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBMS1P29558 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBMS1P29558 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
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