Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BgnP28653 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BgnP28653 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BgnP28653 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BgnP28653 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BgnP28653 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BgnP28653 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BgnP28653 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BgnP28653 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BgnP28653 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BgnP28653 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BgnP28653 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BgnP28653 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BgnP28653 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BgnP28653 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BgnP28653 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BgnP28653 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BgnP28653 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BgnP28653 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BgnP28653 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BgnP28653 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BgnP28653 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BgnP28653 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BgnP28653 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BgnP28653 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BgnP28653 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BgnP28653 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BgnP28653 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BgnP28653 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BgnP28653 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BgnP28653 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BgnP28653 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BgnP28653 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BgnP28653 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BgnP28653 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BgnP28653 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BgnP28653 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BgnP28653 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BgnP28653 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BgnP28653 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BgnP28653 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BgnP28653 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BgnP28653 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BgnP28653 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BgnP28653 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BgnP28653 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BgnP28653 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BgnP28653 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BgnP28653 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BgnP28653 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BgnP28653 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BgnP28653 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BgnP28653 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BgnP28653 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BgnP28653 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BgnP28653 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BgnP28653 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BgnP28653 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BgnP28653 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BgnP28653 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BgnP28653 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BgnP28653 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BgnP28653 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BgnP28653 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BgnP28653 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BgnP28653 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BgnP28653 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BgnP28653 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BgnP28653 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BgnP28653 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BgnP28653 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BgnP28653 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BgnP28653 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BgnP28653 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BgnP28653 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BgnP28653 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BgnP28653 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BgnP28653 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BgnP28653 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BgnP28653 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BgnP28653 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BgnP28653 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BgnP28653 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BgnP28653 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BgnP28653 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BgnP28653 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BgnP28653 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BgnP28653 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BgnP28653 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BgnP28653 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BgnP28653 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BgnP28653 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BgnP28653 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BgnP28653 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BgnP28653 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BgnP28653 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BgnP28653 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BgnP28653 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BgnP28653 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BgnP28653 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms