Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gjb1P28230 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Gjb1P28230 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gjb1P28230 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gjb1P28230 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gjb1P28230 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gjb1P28230 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gjb1P28230 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gjb1P28230 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gjb1P28230 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gjb1P28230 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gjb1P28230 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gjb1P28230 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gjb1P28230 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gjb1P28230 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gjb1P28230 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gjb1P28230 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gjb1P28230 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gjb1P28230 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Gjb1P28230 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gjb1P28230 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gjb1P28230 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gjb1P28230 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gjb1P28230 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gjb1P28230 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gjb1P28230 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gjb1P28230 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gjb1P28230 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gjb1P28230 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Gjb1P28230 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gjb1P28230 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Gjb1P28230 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gjb1P28230 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gjb1P28230 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gjb1P28230 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gjb1P28230 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gjb1P28230 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gjb1P28230 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Gjb1P28230 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Gjb1P28230 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gjb1P28230 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gjb1P28230 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gjb1P28230 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gjb1P28230 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gjb1P28230 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gjb1P28230 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gjb1P28230 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gjb1P28230 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gjb1P28230 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gjb1P28230 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gjb1P28230 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gjb1P28230 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gjb1P28230 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gjb1P28230 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gjb1P28230 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gjb1P28230 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gjb1P28230 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gjb1P28230 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gjb1P28230 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gjb1P28230 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gjb1P28230 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gjb1P28230 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gjb1P28230 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Gjb1P28230 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gjb1P28230 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gjb1P28230 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gjb1P28230 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gjb1P28230 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gjb1P28230 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gjb1P28230 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gjb1P28230 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gjb1P28230 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Gjb1P28230 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Gjb1P28230 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gjb1P28230 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gjb1P28230 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Gjb1P28230 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gjb1P28230 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gjb1P28230 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gjb1P28230 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gjb1P28230 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gjb1P28230 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gjb1P28230 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gjb1P28230 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gjb1P28230 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gjb1P28230 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gjb1P28230 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gjb1P28230 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gjb1P28230 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gjb1P28230 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gjb1P28230 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gjb1P28230 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gjb1P28230 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gjb1P28230 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gjb1P28230 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gjb1P28230 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gjb1P28230 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gjb1P28230 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gjb1P28230 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gjb1P28230 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.7 ms