Protein–RNA interactions for Protein: P25106

ACKR3, Atypical chemokine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR3P25106 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACKR3P25106 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACKR3P25106 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACKR3P25106 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACKR3P25106 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ACKR3P25106 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACKR3P25106 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACKR3P25106 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACKR3P25106 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACKR3P25106 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACKR3P25106 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACKR3P25106 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACKR3P25106 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACKR3P25106 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACKR3P25106 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACKR3P25106 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACKR3P25106 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACKR3P25106 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACKR3P25106 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACKR3P25106 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACKR3P25106 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR3P25106 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR3P25106 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR3P25106 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR3P25106 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACKR3P25106 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACKR3P25106 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACKR3P25106 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACKR3P25106 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACKR3P25106 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACKR3P25106 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACKR3P25106 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACKR3P25106 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACKR3P25106 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACKR3P25106 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACKR3P25106 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACKR3P25106 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACKR3P25106 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACKR3P25106 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms