Protein–RNA interactions for Protein: P25067

COL8A2, Collagen alpha-2(VIII) chain, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL8A2P25067 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL8A2P25067 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL8A2P25067 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL8A2P25067 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL8A2P25067 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL8A2P25067 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL8A2P25067 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL8A2P25067 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL8A2P25067 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL8A2P25067 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL8A2P25067 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL8A2P25067 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL8A2P25067 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL8A2P25067 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL8A2P25067 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL8A2P25067 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL8A2P25067 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL8A2P25067 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL8A2P25067 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL8A2P25067 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL8A2P25067 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL8A2P25067 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL8A2P25067 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL8A2P25067 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL8A2P25067 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL8A2P25067 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL8A2P25067 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COL8A2P25067 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL8A2P25067 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL8A2P25067 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL8A2P25067 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL8A2P25067 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL8A2P25067 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL8A2P25067 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL8A2P25067 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL8A2P25067 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL8A2P25067 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL8A2P25067 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL8A2P25067 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL8A2P25067 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL8A2P25067 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL8A2P25067 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL8A2P25067 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL8A2P25067 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL8A2P25067 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL8A2P25067 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL8A2P25067 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL8A2P25067 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL8A2P25067 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL8A2P25067 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL8A2P25067 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL8A2P25067 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL8A2P25067 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL8A2P25067 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL8A2P25067 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL8A2P25067 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COL8A2P25067 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COL8A2P25067 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COL8A2P25067 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COL8A2P25067 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL8A2P25067 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL8A2P25067 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL8A2P25067 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL8A2P25067 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL8A2P25067 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL8A2P25067 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL8A2P25067 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL8A2P25067 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COL8A2P25067 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COL8A2P25067 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL8A2P25067 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL8A2P25067 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL8A2P25067 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL8A2P25067 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL8A2P25067 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL8A2P25067 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL8A2P25067 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL8A2P25067 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL8A2P25067 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COL8A2P25067 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms