Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RPS6KB1P23443 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
RPS6KB1P23443 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RPS6KB1P23443 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RPS6KB1P23443 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RPS6KB1P23443 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RPS6KB1P23443 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RPS6KB1P23443 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RPS6KB1P23443 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RPS6KB1P23443 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RPS6KB1P23443 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RPS6KB1P23443 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
RPS6KB1P23443 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RPS6KB1P23443 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RPS6KB1P23443 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RPS6KB1P23443 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RPS6KB1P23443 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RPS6KB1P23443 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RPS6KB1P23443 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RPS6KB1P23443 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RPS6KB1P23443 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RPS6KB1P23443 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RPS6KB1P23443 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RPS6KB1P23443 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RPS6KB1P23443 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RPS6KB1P23443 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RPS6KB1P23443 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RPS6KB1P23443 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RPS6KB1P23443 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
RPS6KB1P23443 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RPS6KB1P23443 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RPS6KB1P23443 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RPS6KB1P23443 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RPS6KB1P23443 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RPS6KB1P23443 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RPS6KB1P23443 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RPS6KB1P23443 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RPS6KB1P23443 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RPS6KB1P23443 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RPS6KB1P23443 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RPS6KB1P23443 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RPS6KB1P23443 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RPS6KB1P23443 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RPS6KB1P23443 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RPS6KB1P23443 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RPS6KB1P23443 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
RPS6KB1P23443 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
RPS6KB1P23443 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RPS6KB1P23443 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RPS6KB1P23443 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RPS6KB1P23443 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RPS6KB1P23443 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RPS6KB1P23443 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RPS6KB1P23443 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
RPS6KB1P23443 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RPS6KB1P23443 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RPS6KB1P23443 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RPS6KB1P23443 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RPS6KB1P23443 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RPS6KB1P23443 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RPS6KB1P23443 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RPS6KB1P23443 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RPS6KB1P23443 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
RPS6KB1P23443 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RPS6KB1P23443 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RPS6KB1P23443 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RPS6KB1P23443 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RPS6KB1P23443 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RPS6KB1P23443 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RPS6KB1P23443 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RPS6KB1P23443 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
RPS6KB1P23443 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RPS6KB1P23443 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RPS6KB1P23443 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RPS6KB1P23443 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RPS6KB1P23443 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RPS6KB1P23443 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RPS6KB1P23443 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RPS6KB1P23443 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RPS6KB1P23443 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
RPS6KB1P23443 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RPS6KB1P23443 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RPS6KB1P23443 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RPS6KB1P23443 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RPS6KB1P23443 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RPS6KB1P23443 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RPS6KB1P23443 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RPS6KB1P23443 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RPS6KB1P23443 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RPS6KB1P23443 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RPS6KB1P23443 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RPS6KB1P23443 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RPS6KB1P23443 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
RPS6KB1P23443 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RPS6KB1P23443 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RPS6KB1P23443 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RPS6KB1P23443 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RPS6KB1P23443 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RPS6KB1P23443 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RPS6KB1P23443 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms