Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CA4P22748 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CA4P22748 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CA4P22748 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CA4P22748 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CA4P22748 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CA4P22748 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CA4P22748 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CA4P22748 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CA4P22748 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CA4P22748 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CA4P22748 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CA4P22748 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CA4P22748 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CA4P22748 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CA4P22748 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CA4P22748 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CA4P22748 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CA4P22748 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CA4P22748 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CA4P22748 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CA4P22748 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CA4P22748 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CA4P22748 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CA4P22748 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CA4P22748 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CA4P22748 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CA4P22748 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CA4P22748 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CA4P22748 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CA4P22748 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CA4P22748 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CA4P22748 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CA4P22748 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CA4P22748 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CA4P22748 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CA4P22748 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CA4P22748 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CA4P22748 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CA4P22748 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CA4P22748 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CA4P22748 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CA4P22748 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CA4P22748 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CA4P22748 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CA4P22748 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CA4P22748 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CA4P22748 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CA4P22748 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CA4P22748 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CA4P22748 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CA4P22748 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CA4P22748 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CA4P22748 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CA4P22748 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CA4P22748 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CA4P22748 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CA4P22748 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CA4P22748 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CA4P22748 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CA4P22748 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CA4P22748 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CA4P22748 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CA4P22748 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CA4P22748 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CA4P22748 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CA4P22748 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CA4P22748 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CA4P22748 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CA4P22748 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CA4P22748 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CA4P22748 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CA4P22748 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CA4P22748 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CA4P22748 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CA4P22748 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CA4P22748 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CA4P22748 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CA4P22748 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CA4P22748 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CA4P22748 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CA4P22748 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CA4P22748 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CA4P22748 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CA4P22748 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CA4P22748 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CA4P22748 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CA4P22748 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CA4P22748 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CA4P22748 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CA4P22748 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CA4P22748 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CA4P22748 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CA4P22748 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CA4P22748 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CA4P22748 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CA4P22748 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CA4P22748 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CA4P22748 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CA4P22748 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms