Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPRR1BP22528 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPRR1BP22528 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR1BP22528 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPRR1BP22528 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms