Protein–RNA interactions for Protein: P21926

CD9, CD9 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD9P21926 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CD9P21926 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CD9P21926 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CD9P21926 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CD9P21926 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD9P21926 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD9P21926 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD9P21926 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD9P21926 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CD9P21926 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD9P21926 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD9P21926 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD9P21926 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD9P21926 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CD9P21926 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD9P21926 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD9P21926 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD9P21926 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD9P21926 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD9P21926 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD9P21926 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD9P21926 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD9P21926 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD9P21926 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD9P21926 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD9P21926 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD9P21926 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD9P21926 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD9P21926 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD9P21926 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD9P21926 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CD9P21926 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD9P21926 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD9P21926 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD9P21926 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD9P21926 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD9P21926 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CD9P21926 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD9P21926 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CD9P21926 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD9P21926 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD9P21926 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD9P21926 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD9P21926 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CD9P21926 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD9P21926 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD9P21926 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CD9P21926 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD9P21926 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD9P21926 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD9P21926 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CD9P21926 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CD9P21926 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD9P21926 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD9P21926 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD9P21926 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD9P21926 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CD9P21926 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD9P21926 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CD9P21926 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CD9P21926 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD9P21926 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD9P21926 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CD9P21926 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CD9P21926 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CD9P21926 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CD9P21926 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD9P21926 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD9P21926 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CD9P21926 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD9P21926 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CD9P21926 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CD9P21926 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CD9P21926 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD9P21926 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD9P21926 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CD9P21926 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD9P21926 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CD9P21926 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CD9P21926 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD9P21926 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD9P21926 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD9P21926 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD9P21926 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CD9P21926 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD9P21926 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD9P21926 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD9P21926 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD9P21926 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD9P21926 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD9P21926 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD9P21926 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD9P21926 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD9P21926 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CD9P21926 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD9P21926 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD9P21926 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CD9P21926 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD9P21926 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD9P21926 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms