Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHA1P21709 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA1P21709 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA1P21709 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA1P21709 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA1P21709 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHA1P21709 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA1P21709 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHA1P21709 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA1P21709 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA1P21709 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA1P21709 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA1P21709 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA1P21709 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA1P21709 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA1P21709 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHA1P21709 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA1P21709 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA1P21709 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA1P21709 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA1P21709 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA1P21709 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA1P21709 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA1P21709 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHA1P21709 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA1P21709 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA1P21709 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA1P21709 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHA1P21709 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA1P21709 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA1P21709 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA1P21709 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA1P21709 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHA1P21709 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EPHA1P21709 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA1P21709 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.4 ms