Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TAF1P21675 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TAF1P21675 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
TAF1P21675 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TAF1P21675 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TAF1P21675 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TAF1P21675 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TAF1P21675 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TAF1P21675 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TAF1P21675 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TAF1P21675 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TAF1P21675 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TAF1P21675 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TAF1P21675 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TAF1P21675 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TAF1P21675 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TAF1P21675 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TAF1P21675 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TAF1P21675 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TAF1P21675 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TAF1P21675 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TAF1P21675 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TAF1P21675 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
TAF1P21675 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TAF1P21675 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TAF1P21675 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TAF1P21675 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TAF1P21675 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TAF1P21675 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
TAF1P21675 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
TAF1P21675 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TAF1P21675 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TAF1P21675 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TAF1P21675 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TAF1P21675 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TAF1P21675 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TAF1P21675 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TAF1P21675 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TAF1P21675 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TAF1P21675 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TAF1P21675 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TAF1P21675 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TAF1P21675 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TAF1P21675 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TAF1P21675 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TAF1P21675 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TAF1P21675 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TAF1P21675 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TAF1P21675 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TAF1P21675 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TAF1P21675 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TAF1P21675 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TAF1P21675 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TAF1P21675 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TAF1P21675 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TAF1P21675 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TAF1P21675 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TAF1P21675 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TAF1P21675 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TAF1P21675 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TAF1P21675 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TAF1P21675 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TAF1P21675 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TAF1P21675 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TAF1P21675 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TAF1P21675 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TAF1P21675 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TAF1P21675 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TAF1P21675 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TAF1P21675 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TAF1P21675 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TAF1P21675 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TAF1P21675 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TAF1P21675 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TAF1P21675 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TAF1P21675 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TAF1P21675 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
TAF1P21675 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TAF1P21675 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TAF1P21675 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TAF1P21675 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
TAF1P21675 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TAF1P21675 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TAF1P21675 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TAF1P21675 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TAF1P21675 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TAF1P21675 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TAF1P21675 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TAF1P21675 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TAF1P21675 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TAF1P21675 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TAF1P21675 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
TAF1P21675 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TAF1P21675 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TAF1P21675 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TAF1P21675 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TAF1P21675 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TAF1P21675 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TAF1P21675 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TAF1P21675 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms